تتركز بالصحراء الشرقية معظم خامات مصر المعدنية حيث تتوافر فيها خامات المناجم والمحاجر أما بالنسبة للمنطقة الجنوبية فهي غنية بالثروات المعدنية وأهمها الذهب الذي يتواجد في منطقة بيتان وجبل حوتيت بأبرق كما يتواجد خام التلك بدرجة نقاء عالية تصلح للتصدير وهو يستخدم في العديد من الصناعات منها مواد التجميل والورق والبويات والمطاط ومن خامات المناجم الموجودة وبوفرة خام الكروميت الذي يستخدم في صناعة الطوب الحراري والصناعات الكهربية وكذلك خام الميكا الذي يستخدم في العديد من الصناعات أهمها صناعة العوازل الكهربية كما يتواجد خام الباريت المعروف بثقل كثافته النوعية لذا يستخدم في صناعة طمي الحفر المستخدم في استخراج البترول ويقوم بالرقابة على هذه الخامات تفتيش مناجم الشلاتين أما خامات المحاجر فهي كثيرة منها الجرانيت والبازلت والرخام وخامات أخرى مثل الزلط ورمال الرديم ولا يستغل أيا منها سوى الزلط ورمال الرديم ويشرف عليه مشروع محاجر الشلاتين وكذلك تنتشر بالمنطقة خامات أخرى مثل الفلسبار والكوارتز والالمنيت ولايتم استغلالها بصورة كبيرة في الوقت الحالي